Daha sonra Captain America'ya İngiltere, Londra'da yardım etmek için tekrar ortaya çıkar. Biyonik kolu kopar ve Nick Fury'den hem görev hem de kopan kolu yerine yeni bir kol ister. Civil War'da Winter Soldier, Nick Fury ile beraber Steve Rogers'ı kaçırma planı yapar ancak planı uygulayamadan Rogers uğradığı suikast sonucu hayatını kaybeder. Winter Soldier bu olaydan dolayı Tony Stark'ı suçlar ve onu öldürmeye karar verir. S.H.I.E.L.D.'dan Captain America'nın kalkanını çalar ve Black Widow'a onu saklaması için verir. Bu arada Red Skull'ın Lukin'in zihnine girdiği ortaya çıkar ve onu durdurmak için Kronas'ın üssüne gider. Orada bulunan şeytani psikiyatrist Dr. Faustus, Bucky'nin beynini tekrar yıkamaya çalışır ancak başarılı olamaz.
Faustus'tan kaçan Winter Soldier, S.H.I.E.L.D. tarafından yakalanır. Tony Stark ona Steve Rogers'ın ölmeden önce kendisine yazmış olduğu mektuptan bahseder. Rogers'ın, kendisinden Bucky'ye sahip çıkmasını ve onu yeni Captain America yapmasını istediğinden söz eder. Winter Soldier bu teklifi bir şartla kabul edeceğini söyler, artık bilinçaltı mesajları veya gizli zihinsel programlamalar olmadan kendi özgür iradesiyle yaşamak istediğini belirtir. Stark bunu kabul eder. Bucky'nin yeni kostümü adamantiyumla kaplanır, silah olarak bir tabanca ve bıçak takılır. Captain America olarak ilk macerası S.H.I.E.L.D. ekibinden Falcon ve Carter ile birlikte Orjinal Red Skull'a saldırmak olur. Red Skull'ın başkan heyetine düzenlemeyi planladığı saldırıyı önler ve kamuoyundan büyük takdir toplar. Black Widow ile tekrar arkadaş olur.
Avengers/Invaders mini serisinde Barnes'ın genç hali 1941 yılından 2008 yılına teleport olur ve Bucky, Captain America olarak kendi gençliğiyle yüzleşir. Genç Barnes, Alman üssü zannettiği S.H.I.E.L.D.'ın taşıyıcı gemisine saldırı düzenler ve karşısında Captain America olan Barnes'ı bulur. Captain America ona gerçek kimliğini söylemez, sadece kolunun kopup Winter Soldier'a dönüştüğü o uçak kazasından bahseder ve o kazayı engellemek için ona uyarıda bulunur.
Secret Invasion hikayesinde Captain America, çoğu kahraman öldükten sonra Thor'u Central Park'ta sivilleri savunurken görür. Thor ile savaşır ve karşı gruba katılır. Karşı grupta Nick Fury, Mighty Avengers, New Avengers, Initiative, Thunderbolts, Young Avengers ve Hood'un grubu vardır. Birlikte Kraliçe Veranke'nin önderliğini yaptığı Super-Skrulls'a karşı mücadele ederler. Captain America daha sonra ölmüş olan Human Torch'un bedeninin Profesör Zhang Chin tarafından çalındığını öğrenir ve onun peşine düşer. Profesörün amacı cesedi kullanarak dünyanın yarı nüfusunu öldürecek bir virüs üretmektir. Captain America, Namor ile birleşerek onu durdurur ve Human Torch'a düzgün bir defin töreni düzenler.
Secret Invasion hikayesinin sonunda Captain America, New Avengers'a katılır ve kendi evini operasyonların ana üssü yapar. Luke Cage ve Jessica Jones'un çocukları Danielle'yi arama çalışmaları yapar. Takımın lideri olarak görülse de tam olarak lider olamaz, çünkü hayatı boyunca hep tek çalışmıştır ve takım tecrübesi yoktur.
Captain America: Reborn serisinde Steve Rogers, Doctor Zola ve Norman Osborn tarafından yapılan zaman-uzay makinasının Sharon tarafından parçalanmasıyla zamana canlı olarak geri döner. Bucky ve Black Widow bu makinayı Osborn'un elinden almak için saldırırlar ancak ikisi de yakalanır. Osborn, Black Widow'a teslim olup Rogers'ın 2. katili olarak ifade vermesini aksi takdirde Bucky'yi öldüreceğini açıklar ve onu gönderir. Bucky'yi Antman ve Falcon kurtarır. Esir düşen Sharon'u kurtarmak için Hawkeye, Black Widow, Falcon, Hank Pym ve Vision ile bir takım oluştururlar. Ekip, Rogers'ın vücuduna girmiş olan Red Skull'ı durdurmak için gemisine saldırır. Bucky, Rogers ile dövüşür. Diğerleri ise Crossbones ve M.O.D.O.K. ekibiyle savaşır. Sin, Bucky'yi omuzundan vurur, bu esnada düşürdüğü kalkanı Rogers alır. Bucky'yi yere indirir ve kalkanıyla biyonik kolunu keser. Bu sırada Rogers aklından Red Skull'ı defeder onun kendi bedeninde daha fazla kötülük yapmasını engeller. Böylelikle kendi bedeninin kontrolünü tekrar almış olur. Red Skull, robot vücuduna geri döner ve Vision onu patlatarak öldürür.
Siege hikayesinde Bucky ve Rogers, Tony Stark'ın Thor'un yıldırımlarından zarar görmüş olan beynini iyileştirmeye çalışır. İkisi de Captain America kostümü giyer ancak Bucky kalkanı Rogers'a verir. Asgard'da yanyana birlikte savaşırlar. Olaylar bittiği zaman Rogers kalkanı Bucky'ye geri verir ve emekli olur. Bucky'yi tek Captain America yapar. Hikayenin sonunda Bucky, Winter Soldier olarak işlediği suçlardan yargılanır ancak o dönemde bilincinin kapalı halde olmasından dolayı Amerikan mahkemesince suçsuz bulunur. Ancak Rus hükümet yetkilileri onu teslim alır ve 2 sivilin ölümüyle alakalı Bucky'yi yargılar. Daha sonra bu cinayetlerin de Rusya'nın Department X'iyle alakalı olduğu ortaya çıkar. Black Widow, Bucky'yi Rusya'dan kaçırıp ABD'ye geri getirir. Bu olaylardan sonra Bucky'nin Captain America olması için çok lekeli olduğu konuşulur.
Fear Itself serisinde Bucky tekrar Captain America olmuştur ancak Sin tarafından öldürülür. Sonsuzluk formülünün enjeksiyonuyla tekrar hayata döndürülür ancak bunu kimse bilmez. Yalnızca Rogers, Nick Fury ve Black Widow bilmektedir. Bucky bu sefer Winter Soldier kimliğiyle tıpkı eskiden olduğu gibi gizli operasyonlar düzenler. Bu sefer bu işi iyilerin tarafında yapmaktadır.
Original Sin serisinde Bucky,Moon Knight ve Gamora'yla birlikte Uatu'nun ölümünü araştırır. Bundan sorumlu olan kişinin Nick Fury olduğu, yıllardır Fury'nin dünyayı gizli uzaylı istilalarından koruduğu ortaya çıkar. Hikaye sonunda Nick Fury ölen Uatu'nun yerine evrenin gözcülük görevini üstlenirken, Bucky ise dünyanın gardiyanlığı görevini Fury'den devralır.